Browsing by Subject "image segmentation"

Now showing 1 - 14 of 14

Access status: Open Access ,
An image analysis method for the automatic measurement of selected morphological features of wheat shoots
(Wydawnictwa AGH, 2011) Sekulska-Nalewajko, Joanna; Gocławski, Jarosław
W artykule przedstawiono algorytm przetwarzania i analizy obrazu, który umożliwia automatyczny pomiar wybranych cech morfologicznych młodych pędów pszenicy. Rośliny te były poddawane oddziaływaniu zarówno metali ciężkich, jak i korzystnemu działaniu selenu, tak że ich potencjalny wzrost może różnić się od grupy kontrolnej. Proponowany system pomiarowy wykorzystuje zeskanowane obrazy liści, które następnie są przetwarzane w środowisku MATLAB, aby wyznaczyć długości i pola powierzchni liści. Po wykonaniu segmentacji wyznaczane są binarne obrazy szkieletów pędów, następnie zamieniane w formę grafu i korygowane w celu wyznaczenia linii środkowych łodygi i liści. Linie te podlegają pomiarom długości po ich wygładzeniu za pomocą funkcji sklejanych 3. stopnia. Wybór punktów odgałęzienia liści i ich najbliżej położonych odpowiedników z drugiej strony liścia pozwala na odcięcie poszczególnych liści i pomiar ich pola powierzchni. Przedstawiono wykonane pomiary długości wybranej populacji pędów i porównano je z wynikami metody manualnej i uproszczonej. Dołączono także przykładowe pomiary pola powierzchni liści roślin wzrastających pod wpływem korzystnego działania selenu i bez niego.
Access status: Open Access ,
An image segmentation method to reveal regions of stress manifestation in stained cucurbits' leaves using LVQ neural network
(Wydawnictwa AGH, 2011) Gocławski, Jarosław; Sekulska-Nalewajko, Joanna
W artykule przedstawiono metodę segmentacji obrazów, która pozwala wykrywać obszary ujawniania się stresu na liściach roślin dyniowatych charakteryzujących się akumulacją reaktywnych form tlenu (ROS), takich jak woda utleniona ($H_{2}O_{2}$) lub anionorodnik ponadtlenkowy ($O_2$). W następstwie specyficznego wybarwiania obszary te dają się odróżnić od nietkniętych części liścia w przestrzeni koloru. Proponowany algorytm, opracowany w środowisku MATLAB, obejmuje segmentację obrazów liści zeskanowanych na wybranym tle, wyłączanie pewnych partii liścia z dalszej analizy i klasyfikację pozostałych pikseli obrazu blaszki liścia w przestrzeni $H$, $S$ (odcień, nasycenie). Klasyfikacja bazuje na sieci neuronowej typu LVQ z kilkoma neuronami w warstwie wewnętrznej i dwoma neuronami warstwy wyjściowej, reprezentującymi piksele obrazu odpowiadające wybarwionej i niewybarwionej tkance liścia. Proces uczenia się sieci wykorzystuje dane pikseli reprezentatywnych obrazów i binarne wzorce klasyfikacji obszarów ujawniania stresu przygotowane manualnie przez specjalistów. Klasyfikator poddano 5-krotnej ocenie krzyżowej dla danych $H$, $S$ obrazu podlegającego uczeniu się i oceniono dla danych z innych obrazów (mających wzorce). Dołączono obliczone błędy klasyfikacji. Eksperymenty wykrywania obszarów stresu przeprowadzone dla serii 12 obrazów dały kilkuprocentowe błędy w porównaniu z klasyfikacją manualną.
Access status: Open Access ,
Analiza porównawcza algorytmów segmentacji drzewa oskrzelowego
(Wydawnictwa AGH, 2009) Fabijańska, Anna; Postolski, Michał; Janaszewski, Marcin Sławomir; Babout, Laurent
In this paper problem of airway tree segmentation from 3D CT chest scans was considered. Especially comparison of two authors' algorithms was provided. The algorithms are 3D region growing approaches. The first method uses hole closing algorithm in order to avoid leakages into the lungs. The second approach guides and constrains region growing by morphological gradient. Results of both considered methods for exemplary data are presented and discussed.
Access status: Open Access ,
Automatyczny pomiar długości korzeni siewek pszenicy z hodowli hydroponicznej przy wykorzystaniu metod przetwarzania i analizy obrazów
(Wydawnictwa AGH, 2009) Gocławski, Jarosław; Sekulska-Nalewajko, Joanna; Gajewska, Ewa Grażyna; Wielanek, Marzena Katarzyna
In the paper an automatic method of length measurement has been presented for the roots of wheat from hydroponic culture, based on image processing and analysis. Evaluation of this feature of root systems is important for the estimation of plant tolerance to environmental factors influencing their productivity. In the proposed method simplified procedure of root preparation is applied and low-cost equipment is assumed consisting of typical scanner device and personal computer. The method includes root image segmentation in colour space, binary image skeletonization and then 3D trees topology reconstruction from 2D skeletons of all individual fibrous roots defined as 1. order roots. The analysis of tree data structures enables the reconstruction of axes of 1. order roots and their lateral branches in the image raster. Root lengths are calculated along these axes following cubic splines smoothing of their routes. The measurements of 1. order roots, carried out for the series of 10 images (about 50 roots) revealed only small differences from the results obtained with manual method - 1,94% in average.
Access status: Restricted ,
Badanie możliwości zastosowania wybranych metod segmentacji do analizy mikroskopowych obrazów skał
(Data obrony: 2016-09-29) Plewa, Joanna
Wydział Geologii, Geofizyki i Ochrony Środowiska
Celem pracy była implementacja wybranych metod segmentacji obrazów oraz analiza wyników pod kątem poprawności działania i użyteczności. Omówione zostały zagadnienia związane z segmentacją obrazów, budową mikroskopu oraz sposobem przygotowania szlifów cienkich. Praca zawiera opis implementacji oraz analizę wyników metod segmentacji punktowej, krawędziowej oraz obszarowej. Do badania wykorzystano mikroskopowe obrazy ziarn skalnych.
Access status: Open Access ,
Ferromagnetic underwater target detection based on a magnetic anomaly map
(Wydawnictwa AGH, 2020) Bodus-Olkowska, Izabela; Uriasz, Janusz
A magnetic anomaly map of an underwater area indicates the places where the distortion of a magnetic field has occurred. Through the interpretation procedures, a hydrographer can easily indicate the places where the ferromagnetic objects are, then calculate the level of each distortion - by the value of total anomaly - and initially, based on their own knowledge, try to classify the sources of distortion. Objects that induce micro anomaly changes (>30 nT) - like industrial infrastructure, such as pipelines and cables, to unintendingly located targets with ferromagnetic characteristics: wrecks (vessels, planes, cars), military mines, UXO, lost anchors and chains. Interpretation of such a map with the attempt to identify the source of magnetic field distortion, requires a specific knowledge as well as experience. In this article the author presents the research results of dimensioning and location of potential ferromagnetic underwater objects based on a magnetic anomaly map. For further consideration an anchor of buoyage system is taken into account. Geolocation of ferromagnetic sources, contours extraction and dimensioning algorithms of ferromagnetic targets have been carried out in Matlab software. The map of magnetic anomaly enhanced with extracted information was developed in ArcGIS. The analysis was carried out for the purpose of the dissertation thesis and the results are used in further research.
Access status: Open Access ,
Graph based image segmentation
(Wydawnictwa AGH, 2011) Fabijańska, Anna
In this paper problem of graph-based image segmentation was regarded. Specifically, min-cut/max-flow approach proposed by Boykov and Jolly was investigated. The influence of functions describing boundary and regional conditions on results of image segmentation of various images were presented and discussed.
Access status: Open Access ,
Metoda segmentacji obrazów jąder komórkowych roślin w cytometrii DNA z heterogenicznym rozkładem wewnątrz jądra
(Wydawnictwa AGH, 2006) Gocławski, Jarosław; Anioł, Patryk
The paper presents an algorithm of plant nuclei image segmentation preceding the procedure of DNA contents measurement. It is based on iterative multilevel thresholding of grey-level differential image, obtained by preliminary subtraction of components in RGB color space. The subtraction reduces non-stained background artifacts. Splitting of merged cell nuclei has been provided using shape-based watershed method referred to the distance transform of the objects. It has been shown, that multilevel thresholding plays a key role in the proper discrimination of nuclei profiles with highly nonuniform DNA distribution.
Access status: Open Access ,
Metoda segmentacji obrazów mikroskopowych komórek roślinnych znakowanych radiograficznie do wyznaczania poziomu syntezy DNA w jądrach komórkowych
(Wydawnictwa AGH, 2007) Gocławski, Jarosław; Sekulska-Nalewajko, Joanna; Anioł, Patryk
This paper presents the segmentation algorithm for autoradiograms of microscopic slices made of radish (Raphanus sativus) root meristematic cells stained with the Feulgen method. The segmentation purpose is the separation of isotopic marked agglomeration areas, what makes the base for subsequent quantitative discrimination of nucleic acid (DNA) synthesis level. The speed of genetic material multiplication can indicate the distortions of plant growth caused by various factors harmful for the environment. The investigated autoradiographic microscopic images are mapped from RGB to HSV colour space, median filtered, processed by morphological operations and finally thresholded to find the searched marker objects and nuclei surfaces. These operations enable image background equalization and artefact reduction. Two different paths of processing have been applied to extract small and bigmarker agglomerations. The proposed algorithm has been developed in MATLAB 7 environment and segmentation results for the series of 10 autoradiograms have been positively verified by cytologists.
Access status: Open Access ,
Nowe algorytmy segmentacji w wysokotemperaturowym przemysłowym systemie analizy obrazów
(Wydawnictwa AGH, 2006) Strzecha, Krzysztof; Fabijańska, Anna; Sankowski, Dominik
In this paper segmentation algorithms for industrial images have been discussed. Particular attention has been paid to image quantitative analysis systems. Images acquired from computerized system for high-temperature measurements of surface properties (wetting angle and surface tension) of liquid and solid in contact have been considered. The importance of image segmentation quality in the measurement process has been explained. Moreover, the analysis of main groups of known methods of image segmentation has been carried out in order to choose methods potentially useful in the measurement system vision unit. Authors' modifications of chosen algorithms have been presented. The modifications have improved precision of specimen shape projection. Finally, attempt to choose the best segmentation technique for analyzed class of images has been made.
Access status: Open Access ,
Segmentacja aorty z obrazów tomografii komputerowej przy użyciu głębokich sieci neuronowych
(Wydawnictwa AGH, 2025) Paniec, Piotr; Stanuch, Maciej; Skalski, Andrzej
W artykule zaproponowano wykorzystanie architektury nnU-Net do segmentacji aorty z obrazów tomografii komputerowej. Przetwarzanie wstępne obejmowało transformację różnych zakresów wartości do zakresu odpowiadającemu skali jednostek Hounsfielda oraz procedurę okienkowania. Na etapie treningu sieci przeprowadzono pięciokrotną walidację krzyżową oraz wytrenowano pięć modeli, których predykcje na zbiorze testowym zostały połączone. Dla modeli uzyskano średni współczynnik Dice'a na poziomie 0,921 oraz IoU równe 0,858, oznaczające wysoką jakość predykcji. Wartość odległości Hausdorffa ujawniła istnienie elementów odstających, a analiza trójwymiarowych rekonstrukcji wskazała obszary o niższej dokładności segmentacji.
Access status: Restricted ,
Segmentacja obrazów mózgu uzyskanych metodą rezonansu magnetycznego: zastosowanie gaussowskiego modelu mieszanego
(Data obrony: 2017-01-23) Złahoda-Huzior, Adriana
Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej
Access status: Open Access ,
Segmentacja wątroby w obrazach TK z wykorzystaniem modelu przybliżonego konturu
(Wydawnictwa AGH, 2006) Ciecholewski, Marcin; Dębski, Krzysztof
The segmentation of the liver structure from a computed tomography (CT) image is an important function of the software designed to assist liver diagnostics, because it allows for the elimination of excess information from the diagnostic process. This paper presents an original method of the automatic segmentation of the liver structure of both healthy organs and those with such specific disorders as hemangiomas and hepatomas. In this paper, the task of segmentation has been implemented through first finding the contour of the liver which is made up of a finite number of joint polylines approximating individual fragments of the liver in the CT image. The initial reference point for the calculations is the lumbar section of the spine which is a central point of any CT image of the liver. Next, the field outside the contour is divided into two polygons and eliminated from the image.
Access status: Open Access ,
Usuwanie nadmiernej segmentacji w transformacji wododziałowej za pomocą analizy skupień
(Wydawnictwa AGH, 2008) Smołka, Jakub; Skublewska-Paszkowska, Maria
Watershed transformation can be applied to color as well as to gray-scale images. It requires a height function as its input. Most images may be converted to the required form by means of a gradient filter suited for the type of image being segmented. Unfortunately, in most cases, the image after watershed transformation is heavily over-segmented. Using simple methods for reducing over-segmentation doesn't give good results. This paper presents a solution to this problem that utilizes cluster analysis. It allows for watershed merging that produces a requested number of classes. Cluster analysis is very flexible. Its parameters can easily be exchanged in order to adapt the method for a particular type of image. Attributes used for watershed merging may take into account information that is disregarded by the watershed transformation itself.